Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GemP55041 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GemP55041 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GemP55041 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GemP55041 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GemP55041 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GemP55041 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GemP55041 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GemP55041 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GemP55041 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GemP55041 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GemP55041 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GemP55041 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GemP55041 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GemP55041 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GemP55041 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GemP55041 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GemP55041 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GemP55041 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GemP55041 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GemP55041 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GemP55041 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GemP55041 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GemP55041 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GemP55041 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms