Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ephb3P54754 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms