Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Faf1P54731 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Faf1P54731 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Faf1P54731 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Faf1P54731 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms