Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PctpP53808 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PctpP53808 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PctpP53808 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PctpP53808 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PctpP53808 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PctpP53808 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PctpP53808 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PctpP53808 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PctpP53808 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PctpP53808 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PctpP53808 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PctpP53808 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PctpP53808 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PctpP53808 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PctpP53808 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PctpP53808 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PctpP53808 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PctpP53808 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PctpP53808 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PctpP53808 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PctpP53808 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PctpP53808 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PctpP53808 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms