Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cxcl5P50228 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms