Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcls1P49710 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcls1P49710 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms