Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpreP49446 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpreP49446 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpreP49446 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtpreP49446 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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