Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CitP49025 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CitP49025 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CitP49025 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CitP49025 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CitP49025 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CitP49025 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CitP49025 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CitP49025 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CitP49025 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CitP49025 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CitP49025 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CitP49025 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CitP49025 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CitP49025 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CitP49025 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CitP49025 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CitP49025 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CitP49025 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CitP49025 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CitP49025 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CitP49025 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CitP49025 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CitP49025 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CitP49025 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CitP49025 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CitP49025 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CitP49025 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CitP49025 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CitP49025 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CitP49025 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CitP49025 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CitP49025 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CitP49025 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CitP49025 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CitP49025 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CitP49025 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CitP49025 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CitP49025 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CitP49025 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CitP49025 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CitP49025 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CitP49025 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CitP49025 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CitP49025 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CitP49025 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CitP49025 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms