Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl13P47963 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl13P47963 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl13P47963 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl13P47963 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl13P47963 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms