Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gli1P47806 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gli1P47806 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gli1P47806 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gli1P47806 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gli1P47806 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gli1P47806 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gli1P47806 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms