Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sdc2P43407 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdc2P43407 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms