Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ItgavP43406 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms