Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms