Protein–RNA interactions for Protein: P42867

Dpagt1, UDP-N-acetylglucosamine--dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpagt1P42867 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpagt1P42867 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpagt1P42867 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms