Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms