Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms