Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Flt1P35969 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Flt1P35969 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Flt1P35969 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Flt1P35969 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Flt1P35969 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Flt1P35969 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Flt1P35969 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Flt1P35969 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Flt1P35969 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Flt1P35969 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flt1P35969 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Flt1P35969 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms