Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprkP35822 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PtprkP35822 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprkP35822 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms