Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rfc1P35601 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms