Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin1P35438 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin1P35438 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grin1P35438 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms