Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn11P35235 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn11P35235 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms