Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh15P33146 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh15P33146 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh15P33146 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms