Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf8P32972 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms