Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Saa4P31532 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Saa4P31532 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Saa4P31532 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms