Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms