Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms