Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctnnd1P30999 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms