Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd8P29595 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nedd8P29595 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms