Protein–RNA interactions for Protein: P29387

Gnb4, Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb4P29387 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnb4P29387 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb4P29387 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms