Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms