Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa2P28309 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa2P28309 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms