Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LoxP28301 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LoxP28301 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LoxP28301 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LoxP28301 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LoxP28301 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LoxP28301 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LoxP28301 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LoxP28301 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LoxP28301 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LoxP28301 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LoxP28301 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LoxP28301 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LoxP28301 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LoxP28301 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms