Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms