Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irf2P23906 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irf2P23906 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irf2P23906 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf2P23906 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf2P23906 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irf2P23906 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irf2P23906 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms