Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd11P23813 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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