Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eP22646 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms