Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f1P21952 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms