Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcb1aP21447 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms