Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fcer1aP20489 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms