Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP20293 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP20293 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP20293 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP20293 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP20293 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP20293 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP20293 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP20293 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP20293 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP20293 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP20293 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP20293 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TP20293 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TP20293 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP20293 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms