Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms