Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms