Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc1P19123 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms