Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18532 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18532 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18532 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18532 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18532 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18532 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18532 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18532 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18532 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18532 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18532 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
P18532 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18532 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18532 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18532 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P18532 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18532 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms