Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18530 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18530 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18530 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18530 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18530 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18530 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18530 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18530 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms