Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms