Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms