Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms