Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prph2P15499 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prph2P15499 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prph2P15499 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prph2P15499 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms