Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd44P15379 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd44P15379 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd44P15379 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd44P15379 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd44P15379 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms